分子|ROX染料在RT-PCR中的作用

大家好,今天我们来讨论一下,我们经常提到的ROX是什么东西,以及它在RT-PCR中的功能是什么? 和FAM,VIC这样的数字荧光染料很像,ROX也是一种

分子|ROX染料在RT-PCR中的作用

大家好,今天我们来讨论一下,我们经常提到的ROX是什么东西,以及它在RT-PCR中的功能是什么?

和FAM,VIC这样的数字荧光染料很像,ROX也是一种荧光分子,当它出现在反应中时,实时PCR仪器可以检测到它发出的信号值。

但是,与其他那些染料不同,ROX是一种被动的染料,这也意味着它的荧光值水平不会因为随DNA的扩增而发生改变,而是一直保持在一个稳定的水平上。

现在,问题来了,为什么我们要设置这样一种稳定的染料,它有什么作用?

实际上,在任何RT-PCR系统中,有几个潜在的来源会激发报告基团,从而形成‘本底’。实际上,任何检测系统也都有这个问题。这些因素包括:

➤ 不均匀的照明;

➤ 各孔光学的轻微变化;

➤ 凝结量的差异。

ROX在这里就起到一个扣除本底的作用,它会对这些和其他变异源进行归一化处理,并在此过程中提高了数据的精确度,这就像我们在Elisa试剂当中要设计阴性对照一样。

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